تعمل وزارة الصحة على توفير الرعاية الصحية بجميع مستوياتها، وتعزيز الصحة العامة، والوقاية من الأمراض، ووضع القوانين واللوائح المنظمة للقطاع الصحي العام والخاص، ومراقبة أدائه، مع الاهتمام بالجانب البحثي، والتدريب الأكاديمي، ومجالات الاستثمار الصحي. وتقدم الوزارة الرعاية الصحية في المرافق الطبية الحكومية للمواطنين بشكل مجاني، وحسب نظام الرعاية الصحية الجديد المواكب لاحتياجات القطاع الصحي. وكانت الوزارة قد أنشئت بموجب المرسوم الملكي رقم 8697/11/5 وتاريخ 1370/8/26هـ 1951م، بوصفها جهازًا متخصصًا يتولى الإشراف الكامل على الشؤون الصحية بالمملكة. وشهدت نشأة الوزارة تطورات كبيرة كانت بمنزلة علامات بارزة على طريق النهوض بالقطاع الصحي، وتحقيق طموحات جلالة الملك عبدالعزيز بن عبدالرحمن - يرحمه الله. وتشهد الوزارة تطورات كبيرة على طريق النهوض بالقطاع الصحي، وتحقيق طموحات خادم الحرمين الشريفين الملك سلمان بن عبدالعزيز آل سعود، وصاحب السمو الملكي الأمير محمد بن سلمان ولي العهد.
ويتسنم معالي الوزير قمة الهيكل التنظيمي للوزارة، وتتبع له إدارات ومكاتب عدة، منها على سبيل المثال: مكتب تحقيق الرؤية، ومركز تجربة المرضى، وأمانة المجالس والهيئات والتخصصات الصحية، وبرنامج الزائر الصحي، ومديريات الشؤون الصحية بالمناطق وغيرها، ولمعالي الوزير نائبان هما: نائب الوزير للشؤون الصحية، ونائب الوزير للتخطيط والتطوير، وتتبع لهما إدارات ومكاتب متخصصة. وتتبع لمعالي الوزير وكالتان هما: وكالة الوزارة للشؤون الإدارية والمالية، ووكالة الوزارة للموارد البشرية، كما تتبع لمعالي نائب الوزير للشؤون الصحية وكالتان - أيضًا - هما: وكالة الوزارة للصحة العامة، ووكالة الوزارة للخدمات العلاجية، بينما تتبع لنائب الوزير للتخطيط والتطوير ثلاث وكالات، هي: وكالة الوزارة للصحة الإلكترونية، ووكالة الوزارة للتخطيط والتحول، ووكالة الوزارة للإمداد والشؤون الهندسية. وبالوزارة 22 وكالة مساعدة تضم الإدارات العامة كافة.